Genómica Funcional (Functional Genomics)

Código: 1693
Responsável: Maria da Glória Calado Inglês Esquível
Outros docentes: Maria Wanda Sarujine Viegas, Maria Leonor Mota Morais Cecílio e Sara Barros Queiroz Amâncio
Curso: 2º ciclo – Biologia Funcional

1. Horas de contacto:

2. Objectivos:

Pretende-se que os estudantes:
(1) Compreendam os mecanismos que estão ligados à transmissão e regulação dos padrões de expressão de genes na planta.
(2) Entendam os processos epigenéticos mais comuns.
(3) Saibam adequar as técnicas de engenharia genética e de proteómica ao estudo da função de genes e da manipulação da sua expressão numa perspectiva aplicada.

3. Programa:

Apresentação da Disciplina e definição de conceitos básicos.
Organização dos genomas de plantas e de algas modelos (exemplos: Arabidopsis thaliana, Oryza sativa,Physcomitrella patens, Chlamydomonas reinhartii e Synechocystis sp.).
Métodos de análise em Genómica Funcional.
Processos Epigenéticos. Estabelecimento da heterocromatina e controlo da expressão génica por RNAi. Organização 3D do núcleo e expressão genica. Silenciamento génico por via epigenética. Reprogramação de padrões epigenéticos.
Casos de estudo:
- Expressão génica de transportadores de açucar em Saccharomyces cerevisiae ao longo da fermentação vinária.
- Caracterização funcional do aparelho fotossíntético
- Genómica do metabolismo do sulfato
- Stress abiótico em plantas superiores: o papel dos factores de transcrição
- Expressão génica em stress hídrico, uma abordagem proteómica

4. Bibliografia:

Bibliografia Principal

• Baulcombe D. et al. (2004) RNA silencing in plants, Nature 431: 350-355.
• Leister, D. (Editor) (2005) Plant Funcional Genomics Food Products Press.1- 677.
• Merchant, S., et al. (2007) The Chlamydomonas Genome reveals the evolution of key animal and plant functions Science 318: 245-250.

Bibliografia Complementar

• Abdallah, F., Salamini, F., Leister, D (2000). A prediction of the size and evolutionary origin of the proteome of chloroplast of Arabidopsis. Trends Plant Sci. 5: 141-142.
• Campbell, T.N. and Choy F.Y.N. (2005). RNA interference: past, present and future. Curr. Issues Mol. Biol, 7: 1-6.
• Hunter, T.C. ,Andon, N.L., Koller, A.,Yates, JR III, Haynes P.A. (2002) The functional proteomics toolbox: methods and applications. J. Chromatogr. B 782: 165-181.

5. Avaliação:

Trabalho de Pesquisa 35%
Seminário 30%;
Exame 35%

6. Estimativa total de trabalho: 168 Horas

7. Material Pedagógico para 2010/2011